Workshop: Bases para a Conservação da Biodiversidade do Estado de São Paulo

Grupo de Informática/Informação

Coordenação: George J. Shepherd & Dora A. L. Canhos

  1. Informatização das coleções científicas do Estado de São Paulo

    Propõe-se como linha de apoio das agências de fomento a informatização das coleções científicas do Estado de São Paulo. Este apoio inclui:

    • informatização de coleções históricas
    • informatização de novos acervos
    • acesso internet às coleções científicas
    • apoio quanto ao software a ser adotado

    As coleções que receberem este apoio deverão ter o compromisso formal de tornar os seus dados disponíveis à comunidade em geral via internet (através de seu próprio servidor ou em parceria com outra instituição).

    A comunidade da biotasp deverá criar "guidelines" quanto às opções de software para gerenciamento de coleções, intercâmbio de dados etc.

  2. Adoção de padrões mínimos de dados

    A integração de dados exige a padronização (padrões para macro habitats, para microhabitats etc). É importante desenvolver padrões com o "produtor" de informação e o usuário de informação. É importante conhecer o que já existe internacionalmente em termos de padronização e de como as coleções científicas estão sendo estruturadas mundialmente. Um exemplo de padrão é o Hispid para herbários.

    Discutiu-se dados mínimos de coleções científicas que basicamente inclui campos de identificação (reino, filo, classe, família, gênero, espécie, variedade) dados do coletor (nome, número coleção) data, dados de localização (coordenadas, localidade, município, estado, país), precisão em metros; descrição do ambiente (ecossistema (padrão "ficha"), habitat (texto livre)), fonte (espécime, observação visual, som etc.).

  3. Informação de apoio ao pesquisador

    É fundamental tornar informação de apoio ao trabalho do pesquisador disponível via internet ou em outro meio como cd-rom ou no papel. A Internet é considerda a ferramenta de comunicação do futuro (e presente para alguns) e ideal para sistemas com atualização frequente de dados. Para informações refrências (que não mudam com frequência) é desejável a distribuição em outros meios como cd-rom e papel.

    1. Mapas
      O grupo enfaticamente citou a necessidade de tornar accessível mapas atuais como para planejamento e realização de coletas. É também importante recuperar mapas antigos para validar dados históricos de coleções científicas.

      Portanto sugere como linha de apoio dos órgãos financiadores a disponibilização de mapas à comunidade científica.

    2. Topônimos
      O grupo indica também a necessidade de recuperar e atualizar listas de topônimos, essenciais para a localização de nomes antigos de localidades (inclusive coordenadas geográficas). Esta atividade deve merecer o apoio dos órgãos financiadores.

    3. Material Tipo
      Deve-se apoiar a confecção de bancos de dados de material tipo, contendo imagens e descritores, no Brasil e no exterior.

    4. Repatriação da Informação
      Apoiar iniciativas de repatriação de dados de coleta estratégicos localizados em coleções científicas do exterior.

    5. Informações governamentais
      Como apoio ao trabalho de pesquisa é fundamental ter acesso a, e conhecer, programas de governo e legislação de interesse para a pesquisa em biodiversidade.

  4. Metadatabase

    Propõe-se como linha de apoio a manutenção de um banco de dados com metadata dos bancos de dados das coleções científicas. Nota: metadado é um descritor do banco de dados. Contém informações básicas como o autor (instituição), data, tipo de informação (descrição), a localização/distribuição geográfica e qualidade ou precisão da informação.

  5. Estudo da topografia da rede de informação biotasp

    Propõe-se um estudo da topografia da rede quanto à necessidade ou não, ou quanto ao grau de centralização necessária para a integração e análise dos dados das coleções científicas.

  6. Capacitação

    Propõe-se o apoio à formação de pesquisadores em bioinformática (mestrado e doutorado). Propõe-se a inclusão de treinamento no uso de bioinformática em cursos de graduação.

    Propõe-se também o apoio ao treinamento de pesquisadores nas ferramentas da bioinformática (geoprocessamento, utilização de bancos de dados etc).

  7. Integração da Comunidade

    Propõe-se a manutenção e ampliação da lista de discussão biotasp como elemento integrador da comunidade.

    Propõe-se também a publicação de uma revista eletrônica como veículo de divulgação de informação relevante para o programa biotasp.

Sugestão de conjunto mínimo de dados para intercâmbio

  1. Identificação
    • reino, filo, classe, família, gênero, espécie, variedade
  2. Dados do coletor
    • nome, número coleção
  3. Data
  4. Dados de localização
    • coordenadas, altitude (?), localidade, município, estado, país
  5. Precisão ("accuracy") em metros
  6. Descrição do ambiente
    • ecossistema (padrão "ficha"),
    • habitat (texto livre)
  7. Fonte
    • espécime, observação visual, som etc.


Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP
Centro de Referência em Informação Ambiental, CRIA